Pesquisas desenvolvidas em São Carlos são premiadas
Para compreender melhor o ecossistema da região amazônica, pesquisadores da UFSCar analisam materiais genéticos presentes em seus rios e lagos. Os estudos são coordenados pelo professor do Departamento de Genética e Evolução, Flávio Henrique da Silva. Conhecidos como estudos metagenômicos, as pesquisas se utilizam de sequenciamento de DNA de última geração para analisar materiais genéticos presentes em amostras de águas coletadas de rios e lagos da região amazônica. A diferença em relação a um estudo genômico clássico é que não se parte de DNA isolado de um único organismo, e sim, de uma mistura complexa. O produto do sequenciamento pode indicar os tipos de micro-organismos presentes e seus hábitos. Os estudos realizados pelo professor Silva concentram-se em bactérias e arquéias, um tipo primitivo de micro-organismo que apresenta características que permitem a resistência em ambientes hostis, como alta acidez e temperatura.
Silva explica que a partir da identificação e caracterização das sequências de DNA é possível estudar as características dos micro-organismos, como exigências nutricionais e genes envolvidos em rotas metabólicas específicas de grande interesse para a indústria, como, por exemplo, aqueles envolvidos na degradação de compostos químicos ou na produção de enzimas. O professor esclarece que os genes dos micro-organismos podem atuar como indicadores das características do meio. “Com base no sequenciamento do material genético presente nas amostras podemos descobrir quais os micro-organismos presentes, as suas características, hábitos e rotas metabólicas. Além disso, a partir das sequências de DNA, podemos produzir moléculas para uso industrial, como enzimas e antibióticos. Tudo isso, sem a necessidade de termos os micro-organismos cultivados no laboratório”, exemplifica o docente.
Um outro objetivo muito importante deste projeto é fornecer subsídios para o estabelecimento de correlações entre espécies e ciclos biogeoquímicos na região. O projeto tem parceria com a Petrobras e é pioneiro em estudos de sequências genéticas presentes em água doce. O professor Silva explica que os estudos a partir de amostras de filtrados de água permitem identificar uma maior diversidade de micro-organimos, pois não é necessário desenvolver culturas em laboratório. Isso porque muitas espécies sobrevivem em condições muito específicas, o que dificultaria o seu o cultivo. “Geralmente, as bactérias que podem ser cultivadas em laboratórios representam uma porcentagem muito pequena, abaixo de 5%. O restante não cresce porque o meio de cultura não é apropriado. Desta forma, se analisarmos apenas aquelas que são cultiváveis estaremos subestimando a diversidade do ambiente estudado”, explica o pesquisador.
A partir dos resultados da pesquisa será possível construir um extenso banco de dados de sequências de DNA de micro-organismos de rios e lagos da região amazônica, analisá-las e isolar genes de interesse biotecnológico.
Parte dos resultados foi divulgada no XLII Encontro Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). O trabalho “Bacterial and Archaeal Diversity in Freshwater Habits in the Amazon River”, desenvolvido pela estudante de doutorado do Programa de Pós Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular da UFSCar, Danyelle Toyama, sob orientação do professor Flavio Henrique Silva, recebeu o SBBq Award de melhor pôster do evento. “Esse é o principal congresso do país na área de bioquímica e biologia molecular e conta com um grande número de trabalhos apresentados. O prêmio é um reconhecimento da importância do nosso trabalho pelo meio acadêmico. Esses resultados foram enviados para publicação em uma importante revista internacional na área de microbiologia ambiental”, conclui o docente.
